Ultima si cea mai devastatoare lovitura pentru Bizant a fost uniunea ecleziastica cu Roma. Formal, aceasta a insemnat supunerea Bisericii Ortodoxe Papei de la Roma, din motive pur practice. Unul dupa altul atacurile agresive din partea natiunilor straine au fortat tara sa faca alegerea: ori sa se bizuiasca pe Dumnezeu si pe propriile forte, or sa cedeze principiile lor stravechi, pe care statul fusese intemeiat, si sa obtina in schimb ajutor militar si economic din partea Vestului Latin. Si alegerea a fost facuta. In 1274, Imparatul Mihail Paleologul a decis pentru o concesie de baza in favoarea Vestului. Pentru prima data in istorie, ambasadori din partea Imparatului Bizantin au fost trimisi la Lyon pentru a accepta suprematia Papei de la Roma.